В журнале «Труды Национальной академии наук США» (PNAS) опубликована статья международного коллектива авторов, включающего сотрудников Института археологии и этнографии академика РАН А.П. Деревянко, член-корреспондента РАН М.В. Шунькова и кандидата исторических наук М.Б. Козликина, под названием «Микростратиграфическая сохранность древней ДНК животных и человека в пещерных плейстоценовых отложениях» (Microstratigraphic preservation of ancient faunal and hominin DNA in Pleistocene cave sediments, Proceedings of the National Academy of Sciences, DOI: 10.1073/pnas.2113666118).
ДНК, извлечённая из древних отложений, представляет собой богатый источник для изучения прошлого гомининов и разнообразия окружающей их природной среды. Однако до сих пор мало что известно о том, как ДНК сохраняется в отложениях и в какой степени она может перемещаться между археологическими слоями.
В новом исследовании, проведённом, в основном, палеогенетиками из Института эволюционной антропологии Макса Планка, (Германия), изучена сохранность ДНК в 47 блоках отложений, собранных для микроморфологического анализа из 13 археологических пещер в Евразии, Африке и Северной Америке. В работе показано, что такие блоки, извлечённые по специальной методике из рыхлых пещерных толщ, сохраняют ДНК гомининов и других млекопитающих.
Ключевое значение в этом исследовании имеют образцы из Денисовой пещеры, во многом благодаря изучению которых была разработана и усовершенствована методика извлечения ДНК из древних осадков (см. статью Zavala et al., 2021). Образцы были отобраны специалистами из Института археологии и этнографии СО РАН (Россия) и Вуллонгонгского университета (Австралия).

Фото 1: Отбор образцов для микроморфологического анализа в центральном зале Денисовой пещеры (© ИАЭТ СО РАН)
Было установлено, что наибольшая концентрация ДНК характерна для фрагментов костей и копролитов. В трёх микропробах была обнаружена ДНК неандертальцев, по крайней мере, двух мужчин, генетически тесно связанных с индивидом Денисова 5, фаланга которого ранее была обнаружена в том же слое. Исследование показало, что ДНК в плейстоценовых отложениях остается стабильно локализованной и является надежным источником генетической информации.

Фото 2: Шлифы древних отложений из Денисовой пещеры (© Morley et al., 2019)