Советник директора, заведующий Отделом археологии каменного века, главный научный сотрудник, доктор исторических наук, член-корреспондент РАН
Образование: исторический факультет Иркутского государственного университета (1976),
аспирантура Ленинградского отделения Института археологии АН СССР (1983).
Кандидатская диссертация: «Мустьерские памятники межгорных котловин Центрального Алтая» (1990),
научный руководитель – В.П. Любин.
Докторская диссертация: «Археология и палеогеография палеолита Северо-Западного Алтая» (2001).
Научные интересы: первоначальное заселение человеком Северной Евразии, палеогеография плейстоцена, палеоэкология человека, взаимодействие первобытной культуры и окружающей природной среды.
Научно-организационная деятельность:
руководитель научно-исследовательского стационара «Денисова пещера» на Алтае;
член Ученого совета ИАЭТ СО РАН;
член Диссертационного совета при ИАЭТ СО РАН;
член редколлегии журнала «Археология, этнография и антропология Евразии»;
член редакционного совета журналов «Теория и практика археологических исследований», «Археология Евразийских степей», «Universum Humanitarium»;
член Объединенного ученого совета по гуманитарным наукам СО РАН;
заместитель директора по научной работе (2001 — 2015), директор ИАЭТ СО РАН (2015 — 2019).
Экспедиционная деятельность:
начальник Алтайского палеолитического отряда (1989 – н.в.);
руководитель комплексных исследований самых древних (Карама) и наиболее информативных (Денисова пещера, Усть-Каракол и др.) палеолитических памятников Сибири.
Педагогическая деятельность:
профессор кафедры археологии и этнографии Новосибирского государственного университета, спецкурсы «Палеоэкология человека», «Древнейшая археология Сибири»
Научный руководитель и консультант 2 докторов и 7 кандидатов наук
Членство в научных организациях:
член-корреспондент РАН (2016)
член-корреспондент Германского археологического института (2019)
Почетные звания и награды:
Почетная грамота Президента Российской Федерации за заслуги в развитии отечественной науки (2024)
Заслуженный деятель науки Сибирского отделения РАН (2023)
Лауреат премии имени академика В.П. Алескеева и академика Т.И. Алексеевой (2019)
Лауреат Международной премии Scopus Award Russia (2014)
Почетные грамоты Президиума РАН (2013), Президиума СО РАН (2003, 2013, 2015, 2018), Российского Гуманитарного научного фонда (2013), Российского исторического общества (2019).
Монографии
История Сибири. Т. 1: Каменный и бронзовый век. – Новосибирск, 2022 (в соавт. с Деревянко А.П. и др.).
История Алтая. Т. 1: Древнейшая эпоха, древность и Средневековье. – Барнаул, 2019. (в соавт. с Горбуновым В.В. и др.).
Динамика палеолитических индустрий в Африке и Евразии в позднем плейстоцене и проблема формирования Homo sapiens. – Новосибирск, 2014 (в соавт. с Деревянко А.П., Маркиным С.В.).
Стоянка раннего палеолита Карама на Алтае. – Новосибирск, 2005 (в соавт. с Деревянко А.П. и др.).
Природная среда и человек в палеолите Горного Алтая. – Новосибирск, 2003 (в соавт. с Деревянко А.П. и др.).
Paleolithic of the Altai. – Brussels, 2001 (with Derevianko A.P. et al.).
Мустьерские памятники межгорных котловин Центрального Алтая. – Новосибирск, 1990.
Статьи
Ancient human DNA recovered from a Palaeolithic pendant // Nature.–2023.–Vol. 618. – N 7964 (with Essel E. et al.).
Pleistocene sediment DNA reveals hominin and faunal turnovers at Denisova Cave // Nature.–2021.–Vol. 595.–N. 7867 (with Zavala E. et al.).
Unearthing Neanderthal population history using nuclear and mitochondrial DNA from cave sediments // Science.–2021.–Vol. 372.–N. 6542 (with Vernot B. et al.).
The evolutionary history of Neanderthal and Denisovan Y chromosomes // Science. – 2020. – Vol. 369. –N. 6511 (with Petr M. et. al.).
Кто такие денисовцы? // Археология, этнография и антропология Евразии.–2020.–Т. 48.–№ 3 (в соавт. с Деревянко А.П., Козликиным М.Б.).
Timing of archaic hominin occupation of Denisova Cave in southern Siberia // Nature.–2019.–Vol. 565.–N. 7741 (with Jacobs Z. et al.).
Age estimates for hominin fossils and the onset of the Upper Palaeolithic at Denisova Cave // Nature.–2019.–Vol. 565.–N. 7741 (with Douka K. et al.).
The genome of the offspring of a Neanderthal mother and a Denisovan father // Nature.–2018.–Vol. 561.–N. 7721 (with Slon V. et al.).
Neandertal and Denisovan DNA from Pleistocene sediments // Science. – 2017. – Vol. 356, -N 6338 (with Slon V. et al.).
The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains // Nature. – 2014. – Vol. 505, -N. 7481 (with Prufer K. et al.).
О первоначальном заселении человеком Северной Азии // Фундаментальные проблемы археологии, антропологии и этнографии Евразии. – Новосибирск, 2013.
Новая модель формирования человека современного физического вида // Вестн. РАН. – 2012. – Т. 82. – № 3 (в соавт. с Деревянко А.П.).
A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual // Science. – 2012. – Vol. 338. – N. 6104 (with Meyer M. et al.).
Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia // Nature.–2010.–Vol. 468.–N. 7327 (with Reich D. et al.).
The complete mitochondrial DNA genome of an unknown hominin from southern Siberia // Nature. – 2010. – Vol. 464, -N. 7290 (with Krause Q. et al.).
Публикации о М.В. Шунькове:
Шуньков Михаил Васильевич // Историческая энциклопедия Сибири. – Новосибирск, 2009. – Т. III.
Михаилу Васильевичу Шунькову – 70 лет // Археология, этнография и антропология Евразии.–2023.–№ 2.