Идея создания музея под открытым небом возникла в 1960-е гг., вскоре после организации Института истории филологии и философии СО АН СССР. За неимением площадей первые экспонаты свозились во двор коттеджа по ул. Золотодолинская, 32, где жил академик А.П. Окладников. Здесь были организованы хранение и временная экспозиция будущего музея, пользовавшаяся большой популярностью у жителей и гостей Академгородка. Первым архитектурным объектом явилась колокольня церкви из заполярного города Зашиверска, привезенная в Академгородок в 1969 г. в результате экспедиции Института. В 1971 г. была перевезена и сама церковь. Для хранения этих объектов Институт цитологии и генетики СО АН СССР выделил часть экспериментального поля, на котором были сооружены два амбара-хранилища.
Только в 1981 г. Совет Министров РСФСР принял решение о выделении участка для музея под открытым небом. Осенью того же года А.П. Окладников организовал перевозку всех археологических объектов на отведенную территорию. Такая поспешность была связана с угрозой захвата земли дачниками под самовольную застройку, и, по существу, так сформировалась первая экспозиция археологических памятников музея.
Площадь территории музея составляет 46,5 га. На ней расположено несколько рекреационных зон, археологические, этнографические, архитектурные памятники, экспериментальная площадка, административный корпус, в котором размещена одна из экспозиций.
В зоне архитектурных памятников центральным экспонатом является шедевр русского деревянного зодчества церковь Спаса Нерукотворного образа из Зашиверского острога, построенная в 1700 г. мещанином Андреем Хабаровым. Памятник был подарен Сибирскому отделению АН СССР правительством Якутской АССР и перевезен по инициативе академика А.П. Окладникова с берегов р. Индигирки. Является историко-культурным объектом федерального значения.
На территории музея частично экспонируется Юильский (Казымский) острог из Нижнего Приобья – памятник эпохи освоения Сибири русским населением. Третий архитектурный объект – крестьянское подворье русских Восточной Сибири.
Выделена зона археологических памятников, в которой представлены каменные стелы и изваяния различных эпох от палеолита до средневековья. Здесь же расположен полигон с реконструкциями орудий и приспособлений для ловли животных и охоты. Этнографическая зона представляет собой реконструкцию родового святилища манси.
В 2012 г. после завершения строительства административного корпуса на втором этаже развернута экспозиция, посвященная культуре славянского населения Сибири. Ввод в эксплуатацию административного корпуса позволил проводить мастер-классы и массовые мероприятия. В 2013 г. был организован праздник «Широкая масленица»; в церкви Спаса Нерукотворного образа прошло несколько служб, что вызвало положительный резонанс среди жителей Академгородка. Подобное использование архитектурных памятников повышает их значимость и востребованность.
Ежегодно музей под открытым небом посещают около тысячи человек.
Историко-архитектурный музей под открытым небом работает с 1 июня по 30 сентября. Предварительные заявки на экскурсии для групп от 5 человек принимаются в понедельник-пятницу с 10 до 17 часов с 15 мая по тел.: + 7 (913) 781-54-93.